Transformers One on syntytarina siitä, kuinka TRANSFORMERS-universumin legendaarisimmat hahmot Orion Pax ja D-16 muuttuivat aseveljistä verivihollisiksi nimeltään Optimus Prime ja Megatron. He olivat alkujaan kytkimettömiä botteja vailla kykyä muuntautua ja raatoivat energon-kaivostyöläisinä. Kunnianhimoiselle Orion Paxille se ei kuitenkaan riittänyt, vaan hän vapautti itsensä ja D-16:n päämääränään taistella pahiksia vastaan Johtajuuden Matrixin, energialähteen, löytämiseksi ja Cybertronin pelastamiseksi. Miten heidän ystävyytensä käy?